Alors que la guerre du Golfe est sous les feux de la rampe mondiale, une force clandestine obscure a infiltré les plus hauts niveaux de la CIA, qualifiant de traîtres tous ceux qui résistent. Exilés de leur agence et de leur pays qui les saluaient autrefois comme des héros, le vétéran des Black Ops, Frank Woods et son équipe, se retrouvent traqués par la machine militaire qui les a créés.